Guía docente de Ingeniería y Caracterización de Proteínas (M43/56/2/25)

• Sistemas de expresión  de  proteínas  recombinantes  en  eucariotas  y  procariotas. 
• Métodos  de  purificación de  proteínas recombinantes.
• Mutagénesis dirigida.
• Técnicas de caracterización del estado plegado/desplegado de proteínas.
• Técnicas de caracterización estructural de proteínas.
• Técnicas de caracterización de estados de asociación de proteínas.
• Técnicas de caracterización de interacción proteínas-ligandos.

Buen nivel de inglés a nivel de lectura

Tras cursar esta asignatura, el estudiante sabrá/comprenderá:

• Elegir el sistema de expresión que más se adecue a la proteína de interés. 
• Planificar y diseñar una estrategia adecuada para la purificación de la proteína en estudio, optimizando el rendimiento del proceso.
• Diseñar oligonucleótidos  necesarios para realizar una  mutagénesis dirigida del gen que codifica para la proteína en estudio.
• Utilizar las técnicas básicas de caracterización del estado plegado/desplegado de proteínas.
• Proponer modelos de análisis de los datos obtenidos del plegamiento/desplegamiento de las proteínas en estudio.
• Conocer las aplicaciones de las diferentes técnicas de caracterización de los estados de asociación de las proteínas y los modelos matemáticos que los describen.
• Utilizar  y  saber  analizar  las  técnicas  y  datos obtenidos  del  análisis  de  las  interacciones  entre  las  proteínas  y  sus ligandos

TEMARIO TEÓRICO/PRÁCTICO:

1. Sistemas de expresión de proteínas recombinantes. Métodos de purificación y mutagénesis dirigida.
2. Técnicas de caracterización del estado plegado/desplegado, estructura y estados de asociación de proteínas.
3. Técnicas de caracterización de la interacción proteínas-ligandos

La metodología docente que se emplea, está basada en la resolución de proyectos prácticos. La adquisición de los conceptos teóricos y las destrezas prácticas se adquieren simultáneamente durante el desarrollo del proyecto en el laboratorio. 

Mismo temario integrado con la parte teórica

• Ferhst, Alan R.; Enzyme Structure And Mechanism: A Guide to Protein Folding and Structure; Freeman: New York, 1999.
• Shirley,  B.  A.  (Editor);  Protein  Folding  and  Stability.  Volume  45  de  la  Serie  Methods  In  Molecular  Biology.  Totowa University, Humana Press: New Jersey, 1999.
• Gómez-Moreno Calera, Carlos; Sancho Sanz, Javier; (Coords.) Estructura de proteínas; Ariel Ciencia: Barcelona, 2003.
• Cowan, J.A.; Inorganic Biochemistry. An Introduction; Wiley-Vch: New York, 1997.
• van Holde, K.C.; Johnson, W.C.; Ho, P-S.; Principles of physical Biochemistry, 2ªed.; Pearson: New Jersey, 2006
• Kannitcht, C.; Posttranslational Modifications of proteins. Methods in Molecular Biology; Vol 194; Humana Press:  New Jersey, 2002.

• Artículos científicos de actualidad que se seleccionarán en el momento de impartir la asignatura, debido a su novedad y dependiendo del proyecto que se vaya a desarrollar. 

• http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.b.html Clasificación estructural de proteínas.SCOP http://www.cathdb.info/ Clasificación estructural de proteínas CATH
• http://www.ebi.ac.uk/pdbe/ Protein data Bank
•  http://www.expasy.ch/  Contiene  UniProtKB,  PROSITE,  HAMAP,  SwissVar,  ViralZone,  SWISSMODEL  Repository,  SWISS-2DPAGE, World-2DPAGE, MIAPEGelDB, ENZYME, GlycoSuiteDB, UniPathway.

• MD01 Clases magistrales/expositivas. El equipo docente podrá utilizar para su desarrollo algunos de los siguientes métodos: sesión expositiva, aprendizaje basado en problemas, ejemplificación y estudio de casos. 
• MD02 Clases de resolución de problemas. El equipo docente podrá utilizar algunos de los siguientes métodos para su desarrollo: Aprendizaje basado en problemas; ejemplificación y estudio de casos. 
• MD03 Clases prácticas. El equipo docente podrá recurrir a métodos como estudio de casos, análisis diagnósticos, prácticas de laboratorio, aula de informática, visitas, búsqueda de datos, etc. 
• MD04 Talleres, seminarios, debates, exposición (y/o defensa) de trabajos individuales o en grupo. El equipo docente podrá utilizar para su desarrollo algunos de los siguientes métodos: aprendizaje basado en problemas, ejemplificación y estudio de casos 
• MD05 Tutorías: Programadas y de seguimiento (para trabajos de fin de Máster y Prácticas de Empresa), pudiéndose utilizar en las modalidades personalizada o en grupo, sincrónica (presenciales) o asincrónica (virtuales). La modalidad seleccionada por el equipo docente quedará recogida en la Guía Docente de cada materia 
• MD07 Estudio y trabajo autónomo, individual y/o en grupo 

El artículo 17 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que la convocatoria ordinaria estará basada preferentemente en la evaluación continua del estudiante, excepto para quienes se les haya reconocido el derecho a la evaluación única final.

• Evaluación de asistencia y participación activa. Se basa en la valoración de actitudes e iniciativas de participación activa e interactiva  en  el  desarrollo  de  la  clase,  en  las  tutorías,  o  en  el  grado  de  compromiso  en  el  desarrollo  de  los  trabajos planeados, en las prácticas de laboratorio, cualquier otra tarea asignada, pudiéndose evaluar, si procede, la capacidad de trabajo en equipo. 
• Clases  Prácticas.  Se evaluará  el  grado  de  desempeño  en  la  realización  del  trabajo  experimental,  manejo  de instrumentación y software, análisis e interpretación de datos experimentales y elaboración de registros e informes de resultados.
• Resolución  de  ejercicios  o  proyectos.  Proyecto  o ejercicio  complejo  que,  el  alumno  o  grupo  de  alumnos,  deberá  ir resolviendo  por  etapas  a  lo  largo  del  curso.  Cada  etapa  o  hito  alcanzado  será  evaluado  y  el  alumno  recibirá retroalimentación sobre su éxito o fracaso.

Criterios de evaluación y porcentaje sobre la calificación final:

• Valoración de actitudes e iniciativas de participación activa e interactiva en el desarrollo de la clase, en las tutorías, o en el grado de compromiso en el desarrollo de los trabajos planeados, en las prácticas de laboratorio o cualquier otra tarea asignada, pudiéndose evaluar, si procede, la capacidad de trabajo en equipo:  25% sobre calificación final.
• Desempeño en la realización del trabajo experimental, manejo de instrumentación y software, análisis e interpretación de datos experimentales y elaboración de registros e informes de resultados: 25% sobre calificación final.
• Exposición de trabajos, informes, conclusiones: 50% sobre calificación final.

La calificación de los instrumentos se realiza utilizando una escala de 0 a 10 y  es necesario obtener una calificación igual o superior a 5 en cada una de las partes.

El artículo 19 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que los estudiantes que no hayan superado la asignatura en la convocatoria ordinaria dispondrán de una convocatoria extraordinaria. A ella podrán concurrir todos los estudiantes, con independencia de haber seguido o no un proceso de evaluación continua. De esta forma, el estudiante que no haya realizado la evaluación continua tendrá la posibilidad de obtener el 100% de la calificación mediante la realización de una prueba y/o trabajo.

Consistirá en una prueba escrita sobre los contenido teórico/experimental del curso con preguntas diseñadas para determinar el logro de adquisición de las competencias descritas en el Verifica por parte del alumno.

La calificación de los instrumentos se realiza utilizando una escala de 0 a 10 y  es necesario obtener una calificación igual o superior a 5.

El artículo 8 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que podrán acogerse a la evaluación única final, el estudiante que no pueda cumplir con el método de evaluación continua por causas justificadas.

Para acogerse a la evaluación única final, el estudiante, en las dos primeras semanas de impartición de la asignatura o en las dos semanas siguientes a su matriculación si ésta se ha producido con posterioridad al inicio de las clases o por causa sobrevenidas. Lo solicitará, a través del procedimiento electrónico, a la Coordinación del Máster, quien dará traslado al profesorado correspondiente, alegando y acreditando las razones que le asisten para no poder seguir el sistema de evaluación continua.

Consistirá en una prueba escrita sobre los contenidos teórico/experimental del curso con preguntas deseñadas para determinar el logro de adquisición de las competencias descritas en el Verifica por parte del alumno. Corresponderá al 100% de la calificación.

La calificación de los instrumentos se realiza utilizando una escala de 0 a 10 y  es necesario obtener una calificación igual o superior a 5.

Información de interés para estudiantado con discapacidad y/o Necesidades Específicas de Apoyo Educativo (NEAE): Gestión de servicios y apoyos (https://ve.ugr.es/servicios/atencion-social/estudiantes-con-discapacidad).

Programa SciDavis