Guía docente de Filogenia y Conservación (M64/56/2/18)

• La Filogenia y la Biología de la Conservación son dos de las disciplinas de la Biología que más rápido están creciendo actualmente; sin embargo, la tasa a la que aumenta el número de estudios que integran ambas disciplinas es muy baja. Aunque la Filogenia ha ido permeando en la Biología de la Conservación durante las últimas décadas, la sinergia entre ellas es muy limitada. En la presente materia se introduce al alumno/a a las vías por las que la Biología de la Conservación puede beneficiarse de la información filogenética. Usando como nexo la identificación de unidades de conservación, se desarrollan en profundidad los principales conceptos y las principales metodologías filogenéticas aplicables a dicha identificación, tanto a nivel específico y supra-específico como a nivel infraespecífico. Así, a nivel específico se tratará la identificación de especies mediante técnicas filogenéticas moleculares, la importancia e implicaciones de considerar la diversidad filogenética en conservación; mientras que a nivel infraespecífico se desarrollará en profundidad los conceptos y metodología de la Filogeografía. La materia tendrá un marcado carácter práctico que complementa los conocimientos teóricos adquiridos.

• El alumno sabrá/comprenderá:
  • La importancia y el papel de la diversidad filogenética en la identificación de especies y áreas prioritarias para la conservación. Las bases conceptuales de la teoría de la coalescencia. Los métodos de análisis filogeográfico. Cuáles son las herramientas utilizadas para la evaluación del estatus poblacional y la reconstrucción de la historia demográfica de las poblaciones/taxones.

• El alumno será capaz de:
  • Utilizar filogenias moleculares y datos de distancias genéticas para la identificación de especies. Cuantificar diversidad filogenética. Realizar análisis filogeográficos. Interpretar los estudios filogeográficos para identificar tanto unidades de conservación como  los procesos evolutivos que afectan a las poblaciones de especies amenazadas.

• PARTE 1.- FILOGENIA E IDENTIFICACIÓN DE UNIDADES DE CONSERVACIÓN. DESDE ESPECIES HASTA HÁBITATS.
  • Tema 1.- INTRODUCCIÓN: Sinergia entre Filogenia y Biología de la Conservación.
  • Tema 2.- IDENTIFICACIÓN DE ESPECIES Y EVALUACIÓN DE LOS LÍMITES ESPECÍFICOS: Concepto de especie filogenética. Utilidad de Distancias genéticas. DNA barcoding.
  • Tema 3.- DIVERSIDAD FILOGENÉTICA: Un componente intrínseco de la biodiversidad. Conservando la diversidad filogenética. Índices para cuantificación de la diversidad filogenética. Diversidad filogenética y selección de áreas prioritarias para conservación.
• PARTE 2.- FILOGENIA E IDENTIFICACIÓN DE UNIDADES DE CONSERVACIÓN A NIVEL INFRAESPECÍFICO.
  • Tema 4.- UNIDADES EVOLUTIVAS SIGNIFICATIVAS Y UNIDADES DE MANEJO.
  • Tema 5.- FILOGEOGRAFÍA COMO CRITERIO DE IDENTIFICACIÓN: Marcadores moleculares utilizados. Marco teórico: Teoría de la coalescencia. Métodos de análisis filogeográficos. Análisis cladísticos. Análisis estadísticos. Networks filogenéticos. Datación de genealogías. Estima de parámetros genético-poblacionales a partir de secuencias de ADN.

• Avise JC. 2000. Phylogography: the history and formation of species. Cambridge, Hardvard University Press.
• Avise JC. et al. 1987. Intraspecific phylogeography: the mitocondrial DNA bridge between population genetics and systematics. Annual Review of Ecology and Systematics 18:489-522.
• Funk WC. et al. 2012. Harnessing genomics for delineating conservation units. Trends in Ecology and Evolution 27: 489-496.
• Nielsen R. & Beaumont MA. 2009. Statistical inferences in phylogeography. Molecular Ecology 18: 1034-1047.
• Panchal M. & Beaumont MA. 2010. Evaluating nested clade phylogeographic analysis under models of restricted gene flow. Systematic Biology 59:415-432.
• Pellens R. & Grandcolas P. 2016. Biodiversity Conservation and Phylogenetic Systematics: Preserving our evolutionary heritage in an extinction crisis. Springer.
• Purvis A., Gittleman JL. & Brooks TM. 2005. Phylogeny and conservation. Cambridge University Press.
• Rolland J. et al. 2012. Using phylogenies in conservation: new perspectives. Biology Letters 8: 692-694.
• Tucker et al 2017. A guide to phylogenetic metrics for conservation, community ecology and macroecology. Biological Reviews 92: 698-715.
• Winter M., Devictor V. & Schweiger O. 2013. Phylogenetic diversity and nature conservation: where are we? Trends in Ecology and Evolution 28: 199-204.

• MD01 Lección magistral/expositiva 
• MD02 Sesiones de discusión y debate 
• MD03 Resolución de problemas y estudio de casos prácticos 
• MD07 Análisis de fuentes y documentos 
• MD09 Realización de trabajos individuales 

• Valoración final de informes, trabajos,proyectos, etc. (individual o en grupo): 50%-80%
• Pruebas escritas: 20%-30%
• Aportaciones del estudiante en sesiones de discusión y actitud del estudiante en las diferentes actividades desarrolladas: 0%-20%

• La evaluación será:
  • E3. Prueba escrita tipo examen

• La evaluación será:
  • E3. Prueba escrita tipo examen.

Información de interés para estudiantado con discapacidad y/o Necesidades Específicas de Apoyo Educativo (NEAE): Gestión de servicios y apoyos (https://ve.ugr.es/servicios/atencion-social/estudiantes-con-discapacidad).