Guía docente de Técnicas de Imagen en Biomedicina (M78/56/1/31)

Tipos de técnicas de imagen en biomedicina. Fundamentos físicos y tipos de microscopía de fluorescencia. Preparación de muestras y procesado para microscopía óptica. Observación de muestras con proteínas y sensores fluorescentes. Introducción a la imagen digital en microscopía de fluorescencia. Fundamentos de análisis de imagen.

Interés por la asignatura.

Tener conocimientos básicos y adecuados sobre:

• Física.
• Química.
• Bioquímica y Biología Molecular.

Conocimientos   

C04 Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.

Competencias

COM1 Aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.

COM2 Integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios desde una perspectiva sostenible. Competencias  

COM3 Poner en práctica políticas de calidad y de compromiso medioambiental.

COM4 Desarrollar la capacidad de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

COM5 Asumir responsabilidades en lo que respecta al desarrollo de conocimientos y/o prácticas profesionales y a la revisión del rendimiento estratégico de equipos. Liderazgo de proyectos.

COM6 Adquirir conciencia crítica de cuestiones de conocimiento en un campo concreto de la biotecnología y en el punto de unión entre diversos campos como el diagnóstico genético, la identificación, el desarrollo de fármacos, etc. para emitir informes profesionales desde una perspectiva sistémica y compleja.

Tipos de técnicas de imagen en biomedicina.

Fundamentos físicos y tipos de microscopía de fluorescencia.

Preparación de muestras y procesado para microscopía óptica.

Observación de muestras con proteínas y sensores fluorescentes.

Introducción a la imagen digital en microscopía de fluorescencia.

Fundamentos de análisis de imagen.

Preparación de muestras.

Adquisición de imágenes por microscopía de fluorescencia.

Análisis de imágenes de fluorescencia.

• Pawley, J.B. (Ed.) (2006). Handbook of Biological Confocal Microscopy (3rd ed.). Springer.

• Lichtman, J.W. & Conchello, J.A. (2005). Fluorescence microscopy. Nature Methods, 2, 910–919.

• Russ, J.C. (2016). The Image Processing Handbook (7th ed.). CRC Press.

• JR Lakowicz. Principles of fluorescence spectroscopy.Springer; 2 edition

• B Valeur. Molecular fluorescence: Principles and applications.

• Waters, J.C. (2009). Accuracy and precision in quantitative fluorescence microscopy. The Journal of Cell Biology, 185(7), 1135–1148.

• Stellman, C.M. (Ed.) (2013). Cell Biology: A Laboratory Handbook (3rd ed.). Academic Press.

• Goldman, R.D., Swedlow, J.R. & Spector, D.L. (Eds.) (2010). Live Cell Imaging: A Laboratory Manual (2nd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Fiji/ImageJ: https://imagej.net

OME Bio-Formats Project: https://www.openmicroscopy.org

Nikon MicroscopyU: https://www.microscopyu.com

Molecular Expressions Microscopy Primer: https://micro.magnet.fsu.edu

Centre for Bioimage Analysis (University of Zurich): https://www.bioimagingguide.org

Según el Artículo 19, punto 1, de la Normativa de evaluación y calificación de los estudiantes de la Universidad de Granada, los estudiantes podrán presentarse a la convocatoria extraordinaria, independientemente de haber seguido o no un proceso de evaluación continua. La calificación en la convocatoria extraordinaria se ajustará a las reglas establecidas en la guía docente de la asignatura, garantizando siempre la posibilidad de obtener el 100% de la calificación final. Las guías docentes que, en la evaluación ordinaria, incluyan un porcentaje basado en la asistencia o en actividades como participación en clases teóricas, trabajos, o seminarios, no podrán mantener este porcentaje en la convocatoria extraordinaria. Si el estudiante no ha seguido una evaluación continua, se debe garantizar la posibilidad de obtener el 100% de la calificación final.

El artículo 8 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que podrán acogerse a la evaluación única final, el estudiante que no pueda cumplir con el método de evaluación continua por causas justificadas.
Para acogerse a la evaluación única final, el estudiante, en las dos primeras semanas de impartición de la asignatura o en las dos semanas siguientes a su matriculación si ésta se ha producido con posterioridad al inicio de las clases o por causa sobrevenidas. Lo solicitará, a través del procedimiento electrónico, a la Coordinación del Máster, quien dará traslado al profesorado correspondiente, alegando y acreditando las razones que le asisten para no poder seguir el sistema de evaluación continua.
La evaluación en tal caso consistirá en:
Se realizará un examen teórico-práctico, presencial, de un máximo de dos horas sobre los contenidos de la asignatura. A continuación, se establecerá un debate sobre las preguntas, con una duración máxima de una hora.

INCLUSIÓN Y DIVERSIDAD DE LA UGR
En el caso de estudiantes con discapacidad u otras necesidades específicas de apoyo educativo, el sistema de tutoría deberá adaptarse a sus necesidades, de acuerdo a las recomendaciones de la Unidad de Inclusión de la Universidad, procediendo los Departamentos y Centros a establecer las medidas adecuadas para que las tutorías se realicen en lugares accesibles. Asimismo, a petición del profesor, se podrá solicitar apoyo a la unidad competente de la Universidad cuando se trate de adaptaciones metodológicas especiales.

GRABACIÓN DE IMAGEN Y/O AUDIO
Salvo autorización expresa por parte del profesor, no está permitida la grabación, total o parcial, tanto de sonido como de imagen, de las clases, seminarios o prácticas de la asignatura, con arreglo a las previsiones de la Ley de Propiedad Intelectual, de la Ley Orgánica de Protección de Datos de Carácter Personal y de la Ley Orgánica de Protección Civil del Derecho al Honor, a la Intimidad Personal y Familiar y a la Propia Imagen. En función, en su caso, del uso posterior que se le diera, la grabación no consentida puede dar origen a responsabilidades civiles, disciplinarias, administrativas y, eventualmente, penales.

Siguiendo las indicaciones recogidas en la Normativa de Evaluación y de Calificación de los estudiantes de la Universidad de Granada: https://sl.ugr.es/NormativUGR
- La Universidad de Granada fomentará el respeto a la propiedad intelectual y transmitirá a los estudiantes que el plagio es una práctica contraria a los principios que rigen la formación universitaria. Para ello procederá a reconocer la autoría de los trabajos y su protección de acuerdo con la propiedad intelectual según establezca la legislación vigente.
- El plagio, entendido como la presentación de un trabajo u obra hecho por otra persona como propio o la copia de textos sin citar su procedencia y dándolos como de elaboración propia, conllevará automáticamente la calificación numérica de cero en la asignatura en la que se hubiera detectado, independientemente del resto de las calificaciones que el estudiante hubiera obtenido. Esta consecuencia debe entenderse sin perjuicio de las responsabilidades disciplinarias en las que pudieran incurrir los estudiantes que plagien.

Información de interés para estudiantado con discapacidad y/o Necesidades Específicas de Apoyo Educativo (NEAE): Gestión de servicios y apoyos (https://ve.ugr.es/servicios/atencion-social/estudiantes-con-discapacidad).

Fiji (Schindelin, J., Arganda-Carreras, I., Frise, E., Kaynig, V., Longair, M., Pietzsch, T., … Cardona, A. (2012). Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods, 9(7), 676–682. doi:10.1038/nmeth.2019)