Guía docente de Mecanismos y Metodologías de Biología Molecular Aplicada (M78/56/1/23)

• Métodos de purificación de RNA y DNA a partir de muestras biológicas. Pureza y criterios de validación para su uso en Biomedicina.
• Técnica de amplificación de ácidos nucleicos, PCR, RT-PCR y qPCR. Diseño de oligonucleótidos y su uso en la clonación de secuencias de interés para la producción de productos biológicos de interés.
• Vectores de clonación para células procariotas y eucariotas. Técnicas avanzadas de manipulación de ácidos nucleicos, Métodos avanzados de clonación sin usar secuencias de restricción.
• Técnicas de secuenciación y caracterización de secuencias de DNA: secuenciación automática, secuenciación masiva, técnicas de secuenciación para el estudio de las modificaciones epigenéticas.
• Técnicas avanzadas de diagnóstico molecular basadas en la  hibridación de los ácidos nucleicos.

• Se recomienda tener conocimientos básicos de Biología Celular, Biología Molecular.

• Integrar los conocimientos de Biología Molecular en órganos y sistemas funcionales.
• Conocer los aspectos claves de la regulación de los mecanismos moleculares.
• Conocer las influencias de agentes externos sobre el control de los mecanismos moleculares celulares.
• Conocer y saber aplicar la mutación y modificación del material genético.
• Conocer y saber aplicar los conocimientos sobre recambio de proteínas y su degradación controlada.
• Conocer y utilizar adecuadamente técnicas e instrumentación avanzadas de Biología Molecular e ingeniería genética.

• Métodos de purificación de RNA y DNA a partir de muestras biológicas. Pureza y criterios de validación para su uso en Biomedicina.
• Técnica de amplificación de ácidos nucleicos, PCR, RT-PCR y qPCR. Diseño de oligonucleótidos y su uso en la clonación de secuencias de interés para la producción de productos biológicos de interés.
• Vectores de clonación para células procariotas y eucariotas. Técnicas avanzadas de manipulación de ácidos nucleicos, Métodos avanzados de clonación sin usar secuencias de restricción.
• Técnicas de secuenciación y caracterización de secuencias de DNA: secuenciación automática, secuenciación masiva, técnicas de secuenciación para el estudio de las modificaciones epigenéticas.
• Técnicas avanzadas de diagnóstico molecular basadas en la  hibridación de los ácidos nucleicos.

1. Práctica 1. Amplificación a partir de DNA genómico de secuencias promotoras.

• Uso de diferentes estrategias de clonación y de purificación de los fragmentos amplificados .
• Análisis de los mismos mediante restricción y electroforesis en geles de agarosa convencionales y desnaturalizante en poliacrilamida.

2. Práctica 2. Estudio de interacción de una proteína con una secuencia promotora.

• Ensayo de EMSA (Electrophoretic Mobility Shift Assay).
• Electroforesis en Geles nativos en poliacrilamida.
• Análisis de los resultados.

3. Práctica 3. Determinación mediante ELISA de la antigenicidad de proteínas e hidrolizados enzimáticos de leche.

4. Práctica 4. Presentación y discusión de resultados.

• Molecular Biology of the Cell. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. (6thed) Garland Science. 2014.
• Biotechnology. David Clark, Nanette Pazdernik. (2nded) Academic Cell. Elsevier. 2016
• Molecular Biology. David Clark. Academic Cell. Elsevier. 2010
• Principes of Molecular Biology. Burton Tropp. Jones and Bartlett Learning. 2014
• Molecular Cloning. A laboratory manual. Michael Green and Joseph Sambrook. (4thed)
• Cold Spring Harbor Press. 2012, http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/0471142727
• Protocols in Molecular Biology. John Walker ed.Humana Press

• Current Protocols in Molecular Biology. Wiley Online Library.

• BIOEDIT http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/bioedit.html
• BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides/
• GENBANK http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
• ExPASy http://expasy.org/
• GENECARDS V3 HUMAN GENES http://www.genecards.org/
• PROTEIN DATA BANK http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
• OMIM ® http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/
• PUBMED http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
• WATCUT http://watcut.uwaterloo.ca/watcut/watcut/template.php?act=snp_new
• NEBCUTTER http://tools.neb.com/NEBcutter2/
• VIRTUAL RIBOSOME http://www.cbs.dtu.dk/services/VirtualRibosome/
• PRIMER3 http://frodo.wi.mit.edu/primer3/

La evaluación en la convocatoria ordinaria se realizará siguiendo los sistemas de evaluación y calificación se describen en: http://masteres.ugr.es/bioenterprise/pages/info_academica/index

•  30%: Participación activa, implicación y desempeño del estudiante en las actividades desarrolladas durante las clases.    
•  70%: Exposición oral  valorando la relevancia del tema, la claridad en la presentación, la capacidad de argumentación y la participación en el debate.

• Según el Artículo 19, punto 1, de la Normativa de evaluación y calificación de los estudiantes de la Universidad de Granada, los estudiantes podrán presentarse a la convocatoria extraordinaria, independientemente de haber seguido o no un proceso de evaluación continua.
• La calificación en la convocatoria extraordinaria se ajustará a las reglas establecidas en la guía docente de la asignatura, garantizando siempre la posibilidad de obtener el 100% de la calificación final. 

• El artículo 8 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que podrán acogerse a la evaluación única final, el estudiante que no pueda cumplir con el método de evaluación continua por causas justificadas.
• Para acogerse a la evaluación única final, el estudiante, en las dos primeras semanas de impartición de la asignatura o en las dos semanas siguientes a su matriculación si ésta se ha producido con posterioridad al inicio de las clases o por causa sobrevenidas. Lo solicitará, a través del procedimiento electrónico, a la Coordinación del Máster, quien dará traslado al profesorado correspondiente, alegando y acreditando las razones que le asisten para no poder seguir el sistema de evaluación continua.
• El alumno deberá realizar la parte práctica presencialmente y su examen correspondiente.
• Se realizará un examen escrito, presencial, de un máximo de dos horas sobre los contenidos de la asignatura. 

1. INCLUSIÓN Y DIVERSIDAD DE LA UGR

En el caso de estudiantes con discapacidad u otras necesidades específicas de apoyo educativo, el sistema de tutoría deberá adaptarse a sus necesidades, de acuerdo a las recomendaciones de la Unidad de Inclusión de la Universidad, procediendo los Departamentos y Centros a establecer las medidas adecuadas para que las tutorías se realicen en lugares accesibles. Asimismo, a petición del profesor, se podrá solicitar apoyo a la unidad competente de la Universidad cuando se trate de adaptaciones metodológicas especiales.

2. GRABACIÓN DE IMAGEN Y/O AUDIO

Salvo autorización expresa por parte del profesor, no está permitida la grabación, total o parcial, tanto de sonido como de imagen, de las clases, seminarios o prácticas de la asignatura, con arreglo a las previsiones de la Ley de Propiedad Intelectual, de la Ley Orgánica de Protección de Datos de Carácter Personal y de la Ley Orgánica de Protección Civil del Derecho al Honor, a la Intimidad Personal y Familiar y a la Propia Imagen. En función, en su caso, del uso posterior que se le diera, la grabación no consentida puede dar origen a responsabilidades civiles, disciplinarias, administrativas y, eventualmente, penales.

3. IMPORTANTE
Siguiendo las indicaciones recogidas en la Normativa de Evaluación y de Calificación de los estudiantes de la Universidad de Granada: https://sl.ugr.es/NormativUGR
- La Universidad de Granada fomentará el respeto a la propiedad intelectual y transmitirá a los estudiantes que el plagio es una práctica contraria a los principios que rigen la formación universitaria. Para ello procederá a reconocer la autoría de los trabajos y su protección de acuerdo con la propiedad intelectual según establezca la legislación vigente.
- El plagio, entendido como la presentación de un trabajo u obra hecho por otra persona como propio o la copia de textos sin citar su procedencia y dándolos como de elaboración propia, conllevará automáticamente la calificación numérica de cero en la asignatura en la que se hubiera detectado, independientemente del resto de las calificaciones que el estudiante hubiera obtenido. Esta consecuencia debe entenderse sin perjuicio de las responsabilidades disciplinarias en las que pudieran incurrir los estudiantes que plagien.

4. MEDIDAS PREVENTIVAS EN LOS LABORATORIOS DE PRÁCTICAS Y/O TALLERES
Guía de buenas prácticas para laboratorios experimentales docentes (dirigida tanto a estudiantes como a profesorado): https://ssp.ugr.es/informacion/noticias/medidas-preventivas-generaleslaboratorios-talleres
En esta guía se proporciona la información relativa a los principales riesgos para la seguridad y la salud asociados a las prácticas docentes en laboratorios, así como las medidas preventivas necesarias para eliminar y/o minimizar dichos riesgos. También se informa sobre el procedimiento a seguir en caso de accidente y cómo proporcionar un primer auxilio. 

Información de interés para estudiantado con discapacidad y/o Necesidades Específicas de Apoyo Educativo (NEAE): Gestión de servicios y apoyos (https://ve.ugr.es/servicios/atencion-social/estudiantes-con-discapacidad).